MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4e

Total Repeats: 12100

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011981	CTG	2	6	181939	181944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102575
3502	NC_011981	GCATAG	2	12	181949	181960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222102575
3503	NC_011981	ATC	2	6	181966	181971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102575
3504	NC_011981	CGAG	2	8	182065	182072	25 %	0 %	50 %	25 %	222102575
3505	NC_011981	CAT	2	6	182079	182084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102575
3506	NC_011981	GCA	2	6	182138	182143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102575
3507	NC_011981	CAG	2	6	182152	182157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102575
3508	NC_011981	AAT	2	6	182206	182211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102575
3509	NC_011981	CTG	2	6	182212	182217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102575
3510	NC_011981	CCA	2	6	182337	182342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102575
3511	NC_011981	CCG	2	6	182436	182441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102575
3512	NC_011981	CAT	2	6	182457	182462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102575
3513	NC_011981	CCA	2	6	182631	182636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102575
3514	NC_011981	CCG	2	6	182675	182680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102575
3515	NC_011981	GCG	2	6	182696	182701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102575
3516	NC_011981	CCG	2	6	182711	182716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102575
3517	NC_011981	CCT	2	6	182789	182794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_011981	CAG	2	6	182832	182837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102576
3519	NC_011981	CAG	2	6	182919	182924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102576
3520	NC_011981	GGCGTG	2	12	182969	182980	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	222102576
3521	NC_011981	CGC	2	6	183009	183014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102576
3522	NC_011981	GCA	2	6	183032	183037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102576
3523	NC_011981	GA	3	6	183107	183112	50 %	0 %	50 %	0 %	222102576
3524	NC_011981	ATG	2	6	183136	183141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102576
3525	NC_011981	TGG	2	6	183238	183243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102577
3526	NC_011981	TTG	2	6	183264	183269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102577
3527	NC_011981	CTC	2	6	183347	183352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222102577
3528	NC_011981	GCG	2	6	183384	183389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3529	NC_011981	CAG	2	6	183725	183730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102577
3530	NC_011981	T	6	6	183740	183745	0 %	100 %	0 %	0 %	222102577
3531	NC_011981	TCG	2	6	183774	183779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102577
3532	NC_011981	CCG	2	6	183796	183801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102577
3533	NC_011981	GCCGT	2	10	183825	183834	0 %	20 %	40 %	40 %	222102577
3534	NC_011981	ATG	2	6	183849	183854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102577
3535	NC_011981	ATT	2	6	183944	183949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222102577
3536	NC_011981	GGC	2	6	184067	184072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
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3538	NC_011981	GGCGTA	2	12	184247	184258	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222102577
3539	NC_011981	GC	3	6	184299	184304	0 %	0 %	50 %	50 %	222102577
3540	NC_011981	GGCT	2	8	184316	184323	0 %	25 %	50 %	25 %	222102577
3541	NC_011981	CAC	2	6	184331	184336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102577
3542	NC_011981	CGG	2	6	184339	184344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3543	NC_011981	CAG	2	6	184421	184426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102577
3544	NC_011981	CAT	2	6	184462	184467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102577
3545	NC_011981	CGG	2	6	184513	184518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3546	NC_011981	TGG	2	6	184594	184599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102577
3547	NC_011981	TGGTGT	2	12	184615	184626	0 %	50 %	50 %	0 %	222102577
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3549	NC_011981	GCC	2	6	184679	184684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102577
3550	NC_011981	TTC	2	6	184686	184691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102577
3551	NC_011981	CCA	2	6	184734	184739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102577
3552	NC_011981	GGC	2	6	184742	184747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3553	NC_011981	CAA	2	6	184754	184759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102577
3554	NC_011981	GCG	2	6	184766	184771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102577
3555	NC_011981	GTTT	2	8	184821	184828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_011981	GGC	2	6	184835	184840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102578
3557	NC_011981	CCA	2	6	184855	184860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102578
3558	NC_011981	CAT	2	6	184897	184902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3559	NC_011981	CAA	2	6	184903	184908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102578
3560	NC_011981	GGGC	2	8	184924	184931	0 %	0 %	75 %	25 %	222102578
3561	NC_011981	CTG	2	6	185080	185085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102578
3562	NC_011981	TTG	2	6	185091	185096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102578
3563	NC_011981	GCG	2	6	185148	185153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102578
3564	NC_011981	ACA	2	6	185293	185298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102578
3565	NC_011981	GCA	2	6	185400	185405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102578
3566	NC_011981	TCA	2	6	185523	185528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3567	NC_011981	ATC	2	6	185559	185564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3568	NC_011981	CGC	2	6	185572	185577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102578
3569	NC_011981	CGG	2	6	185590	185595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102578
3570	NC_011981	TGG	2	6	185668	185673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102578
3571	NC_011981	CAT	2	6	185680	185685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102578
3572	NC_011981	CG	3	6	185768	185773	0 %	0 %	50 %	50 %	222102578
3573	NC_011981	CAC	2	6	185819	185824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102578
3574	NC_011981	ATCA	2	8	185981	185988	50 %	25 %	0 %	25 %	222102578
3575	NC_011981	GAG	2	6	186015	186020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102578
3576	NC_011981	TGA	2	6	186092	186097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_011981	AAT	2	6	186161	186166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102579
3578	NC_011981	TCG	2	6	186172	186177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102579
3579	NC_011981	CCA	2	6	186242	186247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102579
3580	NC_011981	GAT	2	6	186264	186269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102579
3581	NC_011981	CTTG	2	8	186296	186303	0 %	50 %	25 %	25 %	222102579
3582	NC_011981	GCCACG	2	12	186315	186326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222102579
3583	NC_011981	CATG	2	8	186328	186335	25 %	25 %	25 %	25 %	222102579
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3586	NC_011981	TGCC	2	8	186389	186396	0 %	25 %	25 %	50 %	222102579
3587	NC_011981	CAC	2	6	186444	186449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102579
3588	NC_011981	TGA	2	6	186458	186463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102579
3589	NC_011981	AGG	2	6	186485	186490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222102579
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3591	NC_011981	GC	3	6	186551	186556	0 %	0 %	50 %	50 %	222102579
3592	NC_011981	GGCG	2	8	186590	186597	0 %	0 %	75 %	25 %	222102579
3593	NC_011981	GGC	2	6	186640	186645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222102579
3594	NC_011981	GTT	2	6	186678	186683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102579
3595	NC_011981	ATGG	2	8	186936	186943	25 %	25 %	50 %	0 %	222102579
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3600	NC_011981	TGG	2	6	187130	187135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222102579
3601	NC_011981	TTTC	2	8	187294	187301	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_011981	CAGG	2	8	187309	187316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_011981	G	6	6	187341	187346	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_011981	CTG	2	6	187358	187363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_011981	GTG	3	9	187410	187418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_011981	A	6	6	187528	187533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_011981	ATATA	2	10	187536	187545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_011981	T	6	6	187615	187620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_011981	TGC	2	6	187656	187661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_011981	ACGA	2	8	187724	187731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_011981	GCC	2	6	187810	187815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_011981	AGC	2	6	187852	187857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_011981	GCG	2	6	187858	187863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_011981	T	6	6	187911	187916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_011981	TCT	2	6	187947	187952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_011981	GAAAA	2	10	187987	187996	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_011981	GCG	2	6	188004	188009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_011981	ATA	2	6	188021	188026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222102580
3619	NC_011981	TCT	2	6	188086	188091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222102580
3620	NC_011981	GGCT	2	8	188223	188230	0 %	25 %	50 %	25 %	222102580
3621	NC_011981	CAA	2	6	188232	188237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222102580
3622	NC_011981	TCGA	2	8	188263	188270	25 %	25 %	25 %	25 %	222102580
3623	NC_011981	GCT	2	6	188290	188295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102580
3624	NC_011981	CTG	2	6	188402	188407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102580
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3626	NC_011981	GCT	2	6	188544	188549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102580
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3869	NC_011981	CCG	2	6	200856	200861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222102593
3870	NC_011981	CAT	2	6	200900	200905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222102593
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3872	NC_011981	A	6	6	201015	201020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3991	NC_011981	GTT	2	6	207924	207929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222102600
3992	NC_011981	CGA	4	12	207941	207952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222102600
3993	NC_011981	CCA	2	6	207977	207982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222102600
3994	NC_011981	TGC	2	6	208037	208042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102600
3995	NC_011981	GGCA	2	8	208225	208232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_011981	GAT	2	6	208418	208423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222102601
3997	NC_011981	CACC	2	8	208444	208451	25 %	0 %	0 %	75 %	222102601
3998	NC_011981	CCCG	2	8	208502	208509	0 %	0 %	25 %	75 %	222102601
3999	NC_011981	CGAT	2	8	208515	208522	25 %	25 %	25 %	25 %	222102601
4000	NC_011981	CTG	2	6	208558	208563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222102601

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